Claim Missing Document
Check
Articles

Found 6 Documents
Search
Journal : BIOEDUSCIENCE

Struktur 3D Protein Struktural VP1 pada Enterovirus A71 Menggunakan Swiss-Model Suprianto; Made Budiarsa; Fatmah Dhafir
BIOEDUSCIENCE Vol 4 No 1 (2020): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (642.404 KB) | DOI: 10.29405/j.bes/4137-474353

Abstract

Background: Protein struktural VP1 berperan sebagai pemain kunci dalam patogenesis, memiliki keunikan yang cukup menarik untuk dikaji dengan mempelajari sifat dan fungsi protein struktural VP1. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi struktur tiga dimensi protein VP1 pada EV-A71. Metode: Protein target diperoleh dari server UniProt dengan kode akses A0A097EV89 menggunakan template 4cey.1.A (PDB ID) dianalisis secara in silico melalui metode homologi menggunakan server SWISS-MODEL. Hasil: analisis penelitian menunjukkan protein target dan template memiliki identity 95,29 % dan tersusun dari 297 asam amino dengan nilai QMEAN -2,15. Protein struktural VP1 pada Ramachandran Plots memiliki struktur stabil, residu non-glisin pada daerah outlier hanya berkisar 0,34 % (A53 ALA) dengan Nilai rotamer outliers 1,61 %. Kesimpulan: Model struktur tiga dimensi protein yang diteliti memiliki struktur stabil dan informasi yang didapatkan berguna untuk penelitian lebih lanjut dalam pengembangan vaksin penyakit yang disebabkan oleh EV-A71.
Variasi Morfometrik Tetragonula laeviceps di Berbagai Habitat di Provinsi Sulawesi Tengah I Made Budiarsa; Fatmah Dhafir; Manap Trianto
BIOEDUSCIENCE Vol 6 No 2 (2022): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (301.233 KB) | DOI: 10.22236/j.bes/625062

Abstract

Background: Habitat is a place for living things to grow and develop. Differences in habitat in an area can affect the size of an organism. This study aims to determine the morphometric variations of Tetragonula laeviceps found in urban and forest habitats in Central Sulawesi Province. Methods: This research was conducted with roaming technique. Morphometric characters observed were 35 characters of stingless bee and analyzed using Microsoft Excel software. Results: The results of this study indicated that the morphometric size variation of T. laeviceps found in forest habitats (3.58 mm) is greater than that of wild bee in urban habitats (3.05 mm). Conclusions: Different habitat characteristics can affect the morphometry variations of the bee, especially in T. laeviceps species. The bee's morphometry body size is greater than in the forest habitat, because in that habitat there are environmental temperatures and types of plant sources of nectar which are more supportive for bee life compared to urban habitats.
Struktur 3D Protein Struktural VP1 pada Enterovirus A71 Menggunakan Swiss-Model Suprianto Suprianto; Made Budiarsa; Fatmah Dhafir
BIOEDUSCIENCE Vol 4 No 1 (2020): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29405/j.bes/4137-474353

Abstract

Background: Protein struktural VP1 berperan sebagai pemain kunci dalam patogenesis, memiliki keunikan yang cukup menarik untuk dikaji dengan mempelajari sifat dan fungsi protein struktural VP1. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi struktur tiga dimensi protein VP1 pada EV-A71. Metode: Protein target diperoleh dari server UniProt dengan kode akses A0A097EV89 menggunakan template 4cey.1.A (PDB ID) dianalisis secara in silico melalui metode homologi menggunakan server SWISS-MODEL. Hasil: analisis penelitian menunjukkan protein target dan template memiliki identity 95,29 % dan tersusun dari 297 asam amino dengan nilai QMEAN -2,15. Protein struktural VP1 pada Ramachandran Plots memiliki struktur stabil, residu non-glisin pada daerah outlier hanya berkisar 0,34 % (A53 ALA) dengan Nilai rotamer outliers 1,61 %. Kesimpulan: Model struktur tiga dimensi protein yang diteliti memiliki struktur stabil dan informasi yang didapatkan berguna untuk penelitian lebih lanjut dalam pengembangan vaksin penyakit yang disebabkan oleh EV-A71.
Variasi Morfometrik Tetragonula laeviceps di Berbagai Habitat di Provinsi Sulawesi Tengah I Made Budiarsa; Fatmah Dhafir; Manap Trianto
BIOEDUSCIENCE Vol 6 No 2 (2022): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22236/j.bes/625062

Abstract

Background: Habitat is a place for living things to grow and develop. Differences in habitat in an area can affect the size of an organism. This study aims to determine the morphometric variations of Tetragonula laeviceps found in urban and forest habitats in Central Sulawesi Province. Methods: This research was conducted with roaming technique. Morphometric characters observed were 35 characters of stingless bee and analyzed using Microsoft Excel software. Results: The results of this study indicated that the morphometric size variation of T. laeviceps found in forest habitats (3.58 mm) is greater than that of wild bee in urban habitats (3.05 mm). Conclusions: Different habitat characteristics can affect the morphometry variations of the bee, especially in T. laeviceps species. The bee's morphometry body size is greater than in the forest habitat, because in that habitat there are environmental temperatures and types of plant sources of nectar which are more supportive for bee life compared to urban habitats.
Struktur 3D Protein Struktural VP1 pada Enterovirus A71 Menggunakan Swiss-Model Suprianto Suprianto; Made Budiarsa; Fatmah Dhafir
BIOEDUSCIENCE Vol 4 No 1 (2020): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29405/j.bes/4137-474353

Abstract

Background: Protein struktural VP1 berperan sebagai pemain kunci dalam patogenesis, memiliki keunikan yang cukup menarik untuk dikaji dengan mempelajari sifat dan fungsi protein struktural VP1. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi struktur tiga dimensi protein VP1 pada EV-A71. Metode: Protein target diperoleh dari server UniProt dengan kode akses A0A097EV89 menggunakan template 4cey.1.A (PDB ID) dianalisis secara in silico melalui metode homologi menggunakan server SWISS-MODEL. Hasil: analisis penelitian menunjukkan protein target dan template memiliki identity 95,29 % dan tersusun dari 297 asam amino dengan nilai QMEAN -2,15. Protein struktural VP1 pada Ramachandran Plots memiliki struktur stabil, residu non-glisin pada daerah outlier hanya berkisar 0,34 % (A53 ALA) dengan Nilai rotamer outliers 1,61 %. Kesimpulan: Model struktur tiga dimensi protein yang diteliti memiliki struktur stabil dan informasi yang didapatkan berguna untuk penelitian lebih lanjut dalam pengembangan vaksin penyakit yang disebabkan oleh EV-A71.
Variasi Morfometrik Tetragonula laeviceps di Berbagai Habitat di Provinsi Sulawesi Tengah I Made Budiarsa; Fatmah Dhafir; Manap Trianto
BIOEDUSCIENCE Vol 6 No 2 (2022): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22236/j.bes/625062

Abstract

Background: Habitat is a place for living things to grow and develop. Differences in habitat in an area can affect the size of an organism. This study aims to determine the morphometric variations of Tetragonula laeviceps found in urban and forest habitats in Central Sulawesi Province. Methods: This research was conducted with roaming technique. Morphometric characters observed were 35 characters of stingless bee and analyzed using Microsoft Excel software. Results: The results of this study indicated that the morphometric size variation of T. laeviceps found in forest habitats (3.58 mm) is greater than that of wild bee in urban habitats (3.05 mm). Conclusions: Different habitat characteristics can affect the morphometry variations of the bee, especially in T. laeviceps species. The bee's morphometry body size is greater than in the forest habitat, because in that habitat there are environmental temperatures and types of plant sources of nectar which are more supportive for bee life compared to urban habitats.
Co-Authors ., Reskiana Abd Hakim Laenggeng, Abd Hakim Abd Rauf Achmad Ramadhan Achmad, Mestawaty As. Ahmad Ramadhan Akram, Akram Amalia Buntu Amiruddin Kasim Anak Agung Putu Agung Suryawan Wiranatha Anak Agung Putu Putra Aro Meko Mbete Aron Meko Mbete Arya Wahyu Widiantara, I Putu Ashari, Abdul Astawa, I Gede Astija Avita, Cindy Dea Baehaqi Bahana Aditya Adnan Bialangi, Mursito S. Biung, Yelsan Kanan Burhanuddin, Alga Patricia Chatarina Umbul Wahyuni Denok Lestari Dewa Ayu Widiasri Dewi Tureni Dwi Lina Sari Tanjung Elza, Tiara Faradila, Ratna Fardini Sabilah Fatmah Dhafir Febri Aspitasari Gede Primahadi Wijaya Rajeg Hasan, Isharyadi Hasanudin, Rezki Hayyatun Mawaddah Herry Arianto Hidyanisa, Dhea Hj. Musdalifah Nurdin I Gde Pitana, I Gde I Gede Putra Nugraha I Gusti Ayu Gede Sosiowati I Gusti Ayu Krisnawati I Ketut Artawa I Ketut Murdana I Ketut Purwata I Ketut Riana I Ketut Wardana I Made Antara I Made Darsana I Made Netra I Made Rai Jaya Widanta I MADE RAJEG I Made Suastra I Nengah Kundera I Nengah Laba I Nengah Sudipa I Nyoman Sudiarta I Nyoman Sunarta I NYOMAN SUPARWA I Nyoman Udayana I WAYAN PASTIKA I Wayan Simpen I Wayan Sugita Ida Ayu Made Puspani Ida Bagus Putra Yadnya Ilahi, Wahyu Abdul Isninar, Isnainar Jesy Valenia Panggabean Kadek Feni Aryati Kadek Purnata Kusumaningati, Lilis Tri Latompai, Nismawati I. Lestari M.P Alibasyah Lilies Lilies Made Antara Made Antara Made Sri Satyawati Maharani, Mirfadz Manap Trianto Manap Trianto MARIA BINTANG Marisa, Fajri Masriani . Messe, Yunita Mohammad Jamhari Muchlis L. Djirimu Muh Annas Abdillah Muhammad F. Rahman Mursito S. Bialangi Mustikawati, Ni Luh Ayu Nabila, Putri Nasution, Annio Indah Lestari Nasution, Rahmad Kurnia Abdik Ni Ketut Sri Rahayuni Ni Luh Nyoman Seri Malini Ni Luh Sutjiati Beratha Ni Luh Yuniarti Ni Made Dhanawaty Ni Made Suryati Ni Putu Herni Susanti Ni Wayan Sartini Novita Mulyana NOVITASARI Nur Alam Nurwahda, Nurwahda Nyoman Ariana Nyoman Surya Wijaya Patigu, Rosi Feraningsih Permatasari, Ni Kadek Dewi Prabhaswari, Putu Indry Puspitasari, Amira Putu Dewi Merlyna Yuda Pramesti Putu Prasanthi Vahini Putu Sandra Putri Astariani Rachmad Suwardi Rafiqa RAFIQA RAFIQA, RAFIQA Rahayu, Irma Septi rofiqoh rofiqoh Safitri, Gusti Ayu Kadek Yunita Salsabila Husna Ramadhani Amara Samsurizal, M. Sulaeman Saridewi, Uut Shamdas, Hj. Gamar B.N SULFIANTI, SULFIANTI Suprianto Suprianto Suprianto Susanti, Putu Herny Sutrisnawati Mardin Syamsul Alam Paturusi Syech Idrus Syech Zainal Tandi, Jenifa Arisa Thelisa . Tulak, David Pebriyanto Tuna, Anjeli Wayan Darma Sedana Widiastuti . Windarsih, Yulia Yafed Syufi Yafet Syufi Yuni Masyita Dewi Zulaikhah Dwi Jayanti